大千世界，位面交汇。 万族林立，群英荟萃。 一位位来自下位面的天之至尊，在这无尽世界，演绎着令人向往的传奇，追求着主宰之路。
在一个晴朗明媚的日子里，自称废柴的学生君逆回十六夜（浅沼晋太郎 配音）、温柔善良爱护小动物的春日部耀（中岛爱 配音）以及高傲自大的大小姐久远飞鸟（布里德卡特•塞拉•惠美 配音）各自收到一封邀请函，信中说道：“告知烦恼众多、拥有异能的少男少女，如果期望一试自己的才能，那么就抛弃世上的一切，到我等的‘箱庭’来”。原来他们三人均为拥有超能力的问题儿童。似乎接受了邀请，他们被抛入风景秀美的箱庭世界，并遇见说明人黑兔（野水伊织 配音）。十六夜他们得知，必须运用天赐的特异功能在箱庭进行难度不等的神魔游戏。不按常理出牌的主人公以及藏着无数秘密的箱庭，一切变得好玩起来…… 本片根据竜ノ湖太郎（文）、天之有（插画）的原作改编。
故事讲述未来30年后，仿真智能人在人类社会被广泛应用。人类为了自身安全，建立了东西方智能岛。一支由智能姬组成的神秘战队，为了维护人类安全和世界和平，一次次地打击异变智能人的犯罪行为和恐怖袭击。
X战警被分散到了各个时间线，从过去，到未来，而他们将在最脆弱的时间点遭遇袭击——如今，1990年代。天启发威，大战来临。
这个社会是否平等呢。真正的“实力”是什么？ 东京都高度育成高等学校。那是宣扬彻底的实力至上主义，以升学率·就业率100%而引以为豪的升学学校。升入那里，被分配到1年D班的绫小路清隆，却发现学校与实力至上主义的招牌相反，学生每个月会得到相当于10万日元、与现金同等价值的分数，在授课和生活态度方面也贯彻放任主义。在梦幻般的高中生活当中，不断地挥金如土、过着自甘堕落日子的同班同学们。但，不久他就得知了学校系统的真面目，并被打入绝望的深渊……！ 来自吊车尾聚集的D班的少年少女们所发现的，是世界的矛盾，还是正当的实力社会？
