影片讲述的故事是，1945年８月，由于美军将要袭击日本本土，I-77潜水艇受命出击，作为最终防卫线。舰长仓本（玉木宏饰）拒绝使用人间鱼雷“回天”（一种由人操纵的自杀性鱼雷），曾经只用普通的鱼雷就击沉过

在儒勒·凡尔纳这部最经典故事的现代版里，有号召力的sociopath Nemo 船长使用他的高科技潜水艇向表面世界发动报复。

戴尔菲娜患了癌症躺在医院里,鲁迪·萨拉萨尔有匹配的骨髓捐献给她以挽救她的生命.如果他捐献他的骨髓他将免于他的劳役之灾获得重新的生活,但是他在去医院的路上逃走了,开始另一种恐惧的日子。

美军阿拉巴马号核子潜水艇再次出航任务时却意外进入时光隧道，只有狄更斯舰长一人生还，虽然X与大众怀疑他的说词，但是蓝斯博士却肯定这可能性，并请他担任时光之旅的潜水艇指挥官，与漂亮能干的马杰丽女博士，重闯神秘百慕达三角洲。他们终于在同一地点再次进入2077年的未来世界，遇到正阴谋引发世界核子大战以达到控制全世界野心的恶魔布莱德克。幸好狄更斯在2077年的后代约翰是抗暴领袖，在一番暴力抗争后终于协助他们逃回潜艇！为了挽救未来世界，他们必须安全返抵美国，改变罪恶的人类历史命运。